学院设有资源与环境（安全工程领域）、土木水利（土木工程领域、人工环境工程领域）两个类别、三个专业领域硕士学位点。

土木水利类别学位点于2020获批成立。安全工程为上海首家相关领域专硕点，2015年首次招生。其突破了传统狭义的生产和公共安全，扩展到土木、机械、电气、轨交、能源等十多个跨学科领域，旨在培养具有“安全+”理念，在所属行业领域具有独立担负工程设计、实施、研究、开发、管理等能力的应用创新型人才。至今，学院成功举办了多次全国性学术和研究生论坛，学位点2018年成功通过专项评估，行业影响日益扩大。

学院现有硕士生导师36人，拥有博士学历的占94%，拥有海外经历的占1/3，多毕业于同济、东南、香港科大、香港理工等重点院校，所从事领域均紧跟国家规划和行业前沿。同时，基于校外实践基地，建立了一支工程经验丰富的校外导师队伍，为每位研究生配备一名校外导师。

学院在培养指导、奖助激励等方面形成了健全的规章制度，具有高效的研究生培养管理与运行机制。至今已毕业200余名，就业率100%，多就业于上海及长三角大型企业事业单位。